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Laminバイオロジー向けのオープンソースデータインフラストラクチャ

オープンソースの Python フレームワークを使用して、データと分析を管理します。 分散データハブで、ドライラボとウェットラボの共同作業を行います。 ラップトップで開始し、どこでもデプロイできます。

2022-06-23
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S22
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Healthcare
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ラミン - バイオロジー向けオープンデータプラットフォーム

オープンソースフレームワークでデータと分析を管理

主な機能

  • 統一されたアクセス: 統一された API と UI ("レイクハウス" ) でデータとメタデータへのアクセスを統一します。断片化されたデータレイクや ELN/LIMS システム全体でクエリを探す必要はありません。
  • データの系譜: ノートブック、スクリプト、パイプライン、UI でデータの系譜を追跡します。同じフレームワークで、出現するデータフローと決定論的なデータフローをモデル化します。Redun、Nextflow、Snakemake などのワークフローマネージャーを統合します。
  • 生物学的レジストリ: 実験メタデータとオントロジーのレジストリを管理します。パブリックオントロジーから簡単にデータをインポートします。
  • データの検証とアノテーション: 1 行の API コールで検証、標準化、アノテーションを行います。タイプ付きラベルを活用して、タイプミスや重複を回避します。
  • データの共同作業: 分散データベース全体でデータを整理します。コピーなしのデータ転送で、Git リポジトリのように、データベースを瞬時に作成およびロードします。
  • 学習とウェアハウジングフレームワーク: アーティファクトを、クエリ可能なデータセットや分析的な洞察などの、より有益な表現に変換します。

ユースケース

  • ドライラボとウェットラボの共同作業: 分散ハブで、ドライラボとウェットラボの共同作業を促進します。
  • API ファーストアクセス: API ファーストアクセスを通じて、科学者とモデルを有効にします。
  • データ管理: 遺伝子、タンパク質、細胞タイプ、組織、サンプル、実験などを管理します。
  • データ統合: ワークフローマネージャーとパブリックオントロジーと統合します。
  • データ標準化: エラーや重複を防ぐために、データを標準化およびアノテーションします。
  • 長期データストレージ: データウェアハウジングと学習のための長期的なメモリを構築します。

価格

Lamin は、さまざまなニーズに合わせて、柔軟な価格プランを提供しています。詳細な価格情報については、お問い合わせください。

チーム

Lamin は、小規模な研究グループから大規模な組織まで、あらゆる規模のチームをサポートするように設計されています。当社のプラットフォームは、シームレスな共同作業と効率的なデータ管理を可能にするため、チームは科学的な発見とイノベーションに集中できます。

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