LaminИнфраструктура открытых данных для биологии

Lamin - Открытая платформа данных для биологии

Управление данными и анализом с помощью фреймворка с открытым исходным кодом

Ключевые особенности

• Единый доступ: Объедините доступ к данным и метаданным с помощью единого API и пользовательского интерфейса ("lakehouse"). Больше не нужно бороться с запросами по фрагментированным озерам данных и системам ELN/LIMS.
• Происхождение данных: Отслеживайте происхождение данных в ноутбуках, скриптах, конвейерах и пользовательском интерфейсе. Моделируйте возникающие и детерминированные потоки данных в одной и той же структуре. Интегрируйте менеджеров рабочих процессов, такие как redun, Nextflow и Snakemake.
• Биологические реестры: Управляйте реестрами для экспериментальных метаданных и онтологий. С легкостью импортируйте данные из общедоступных онтологий.
• Проверка и аннотация данных: Проверяйте, стандартизируйте и аннотируйте с помощью однострочных вызовов API. Используйте типизированные метки, чтобы избежать опечаток и дубликатов.
• Сотрудничество в работе с данными: Организуйте данные в распределенных базах данных. Мгновенно создавайте и загружайте базы данных, как репозитории Git, с передачей данных без копирования.
• Фреймворк для обучения и хранения: Преобразуйте артефакты в более полезные представления, такие как запросные наборы данных и аналитические сведения.

Сценарии использования

• Сотрудничество сухих и влажных лабораторий: Обеспечьте сотрудничество между сухими и влажными лабораториями в распределенном центре.
• Доступ по API в первую очередь: Предоставьте ученым и моделям доступ по API в первую очередь.
• Управление данными: Управляйте генами, белками, типами клеток, тканями, образцами, экспериментами и многим другим.
• Интеграция данных: Интегрируйте с менеджерами рабочих процессов и общедоступными онтологиями.
• Стандартизация данных: Стандартизируйте и аннотируйте данные, чтобы избежать ошибок и дубликатов.
• Долгосрочное хранение данных: Создайте долгосрочную память для хранения данных и обучения.

Цены

Lamin предлагает гибкие ценовые планы, адаптированные к различным потребностям. Свяжитесь с нами для получения подробной информации о ценах и чтобы найти план, который наилучшим образом соответствует вашим требованиям.

Команды

Lamin разработан для поддержки команд любого размера, от небольших исследовательских групп до крупных организаций. Наша платформа обеспечивает бесшовное сотрудничество и эффективное управление данными, гарантируя, что ваша команда может сосредоточиться на научных открытиях и инновациях.