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Lamin用于生物学的开源数据基础设施

使用开源 Python 框架管理数据和分析。 在分布式数据中心中进行干湿实验室协作。 在笔记本电脑上开始使用,并在任何地方部署。

2022-06-23
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Early
S22
4
Healthcare
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Lamin - 生物学的开源数据平台

使用开源框架管理数据和分析

主要功能

  • 统一访问: 通过统一的 API 和 UI("lakehouse")统一访问数据和元数据。不再需要在碎片化的数据湖和 ELN/LIMS 系统中搜索查询。
  • 数据血缘: 跟踪笔记本、脚本、管道和 UI 中的数据血缘。在同一框架中对新出现的和确定性的数据流进行建模。集成诸如 redun、Nextflow 和 Snakemake 之类的工作流管理器。
  • 生物学注册表: 管理实验元数据和本体的注册表。轻松从公共本体中导入数据。
  • 数据验证和注释: 使用单行 API 调用进行验证、标准化和注释。利用类型化标签来避免拼写错误和重复。
  • 数据协作: 在分布式数据库中组织数据。像 Git 存储库一样立即创建和加载数据库,无需复制数据传输。
  • 学习和仓库框架: 将工件转换为更有用的表示形式,例如可查询的数据集和分析见解。

使用案例

  • 干湿实验室协作: 促进干湿实验室在分布式中心进行协作。
  • API 优先访问: 通过 API 优先访问使科学家和模型能够访问。
  • 数据管理: 管理基因、蛋白质、细胞类型、组织、样本、实验等等。
  • 数据集成: 与工作流管理器和公共本体集成。
  • 数据标准化: 标准化和注释数据以避免错误和重复。
  • 长期数据存储: 为数据仓库和学习构建长期记忆。

定价

Lamin 提供灵活的定价计划,以满足不同的需求。请联系我们获取详细的定价信息,并找到最适合您要求的计划。

团队

Lamin 的设计旨在支持各种规模的团队,从小规模研究小组到大规模组织。我们的平台能够实现无缝协作和高效的数据管理,确保您的团队能够专注于科学发现和创新。